Számítógépes molekulamérnökség

Daten

Offizielle Daten in der Fachveröffentlichung für das folgende akademische Jahr: 2020-2021

Thematik

A számítógépes molekulamérnökség a gyógyszertervezés központi, modern területe. A hallgatók megismerkednek e terület elméleti hátterével és gyakorlati (szoftveres) eszközeivel. A Journal Club órákon a hallgatók bevonásával az előző előadásokon tárgyalt területek friss szakcikkeinek bemutatásával mélyítjük el az ismereteket. A hallgatók így saját maguk fedezhetnek fel további összefüggéseket, győződhetnek meg a molekulamérnökség terén szerzett új ismereteik használhatóságáról. Az előadások heti rendszerességgel, vagy (lehetőség szerint) 4 blokkba összevonva kerülnek megtartásra.

Vorlesungen

• 1. A makromolekulák megjelenítése. A VMD és a PyMol programok. - Dr. Hetényi Csaba
• 2. Szerkezeti mérések, változtatások és összehasonlítások. - Dr. Hetényi Csaba
• 3. Bevezetés a makromolekulák szerkezetébe. A peptidek és fehérjék szerkezetei. A biopolimerek szerkezetének kísérleti forrásai. - Dr. Hetényi Csaba
• 4. Példák a szerkezeti változékonyságra. A fehérjék konformációs rendezetlenségének szerepe az Alzheimer-kór és a prion betegségek esetében. Miozin, a motor fehérje: egy szekvencia, sok konformáció. - Dr. Hetényi Csaba
• 5. Molekulafelszín és térfogat számítások. - Dr. Hetényi Csaba
• 6. A kötőhelykeresés egyszwerű módszerei. Kavitációkereső algoritmusok. A PASS program. - Dr. Hetényi Csaba
• 7. A szerkezeti számító módszerek hierarchiája. A QM alapjai. - Dr. Hetényi Csaba
• 8. Molekulamodellező programok. - Dr. Hetényi Csaba
• 9. A molekulamechanika (MM) alapelvei. Erőterek. Kötő- és nemkötő kölcsönhatások. - Dr. Hetényi Csaba
• 10. Az MM programok általános algoritmusa. Programcsomagok. TINKER. - Dr. Hetényi Csaba
• 11. Journal club 1. A gyógyszertervezés számítógépes módszerei és stratégiái - Dr. Hetényi Csaba
• 12. Journal club 2. Komplementer megközelítések - Dr. Hetényi Csaba

Praktika

Seminare

Materialien zum Aneignen des Lehrstoffes

Obligatorische Literatur

Vom Institut veröffentlichter Lehrstoff

Az oktatási anyag a vizsgakérdésekkel együtt a Farmakológiai és Farmakoterápiai Intézet honlapján vagy az előadáson/e-mailben elküldött linken érhető el.

Skript

Empfohlene Literatur

Voraussetzung zum Absolvieren des Semesters

Semesteranforderungen

A szemeszter végén zárthelyi dolgozat kerül meghirdetésre. A dolgozat egyszeri választásos tesztkérdéseket és esszékérdéseket tartalmaz. A jegy a dolgozat eredménye és opcionálisan a Journal Club-ra készített prezentáció értékelése alapján kerül kialakításra. A hallgató a szabályzatban foglaltak szerint javíthatja jegyét.

Möglichkeiten zur Nachholung der Fehlzeiten

Távolmaradás pótlása konzultáció alapján.

Prüfungsfragen

A vizsgakérdések az előadásanyagok végén kerülnek elhelyezésre.

Prüfer

Praktika, Seminarleiter/innen