Bioinformatika

Daten

Offizielle Daten in der Fachveröffentlichung für das folgende akademische Jahr: 2025-2026

Thematik

Egy egyszerű meghatározás szerint a bioinformatika molekuláris biológia számítógépen. Mára, többek között a Humán Genom Projektnek köszönhetően, döbbenetes mennyiségű információ áll rendelkezésre génjeinkről és fehérjéinkről. Mit kezdhetünk ezzel az információval? A bioinformatika célja ezen adatok rendszerezése, a számunkra fontos adatok megkeresése és elemzése. Tantárgyunk ebbe nyújt bepillantást. Olyan kérdésekre keressük majd a választ, mint pl.

- hogyan kereshetjük meg egy adott fehérje DNS és aminosav szekvenciáját az interneten?

- hogyan különíthetők el egy génen belül a kódoló és nem kódoló régiók?

- hogyan jósolhatók meg DNS és fehérjemolekulák tulajdonságai a szekvenciájuk alapján?

- hogyan tervezhetjük meg egy fehérje klónozását?

- mennyire hasonlít ugyanaz a fehérje emberben és egérben?

- hogyan jósolható meg egy fehérje 3D szerkezete?

- hogyan ábrázolható és manipulálható egy fehérje 3D szerkezete?

A tantárgy során a fenti és számos további kérdésnek nemcsak az elméleti alapjait beszéljük meg, de a hallgatók a módszereket a gyakorlatban is kipróbálhatják.

Vorlesungen

Praktika

• 1. Bevezetés - Grama László
• 2. Molekuláris biológiai alapok - Grama László
• 3. Alapvető eszközökről röviden - Grama László
• 4. Fehérje adatbázisok - Grama László
• 5. Nukleotid adatbázisok - Grama László
• 6. Gén és genom adatbázisok. Restrikciós térképezés - Grama László
• 7. PCR primer tervezés. Plazmid térképek - Grama László
• 8. Klónozási példafeladat 1 - Grama László
• 9. Klónozási példafeladat 2 - Grama László
• 10. Hasonlóságkeresés (BLAST) - Grama László
• 11. Többszörös szekvenciaillesztés. Filogenetikai fák. 3D fehérjeszerkezetek - Grama László
• 12. Fehérjeszerkezetek előrejelzése, szimulációk. Publikációs adatbázisok. Referenciakezelés - Grama László

Seminare

• 1. Bevezetés - Grama László
• 2. Molekuláris biológiai alapok - Grama László
• 3. Alapvető eszközökről röviden - Grama László
• 4. Fehérje adatbázisok - Grama László
• 5. Nukleotid adatbázisok - Grama László
• 6. Gén és genom adatbázisok. Restrikciós térképezés - Grama László
• 7. PCR primer tervezés. Plazmid térképek - Grama László
• 8. Klónozási példafeladat 1 - Grama László
• 9. Klónozási példafeladat 2 - Grama László
• 10. Hasonlóságkeresés (BLAST) - Grama László
• 11. Többszörös szekvenciaillesztés. Filogenetikai fák. 3D fehérjeszerkezetek - Grama László
• 12. Fehérjeszerkezetek előrejelzése, szimulációk. Publikációs adatbázisok. Referenciakezelés - Grama László

Materialien zum Aneignen des Lehrstoffes

Obligatorische Literatur

Vom Institut veröffentlichter Lehrstoff

http://biofizika.aok.pte.hu

Skript

Empfohlene Literatur

Voraussetzung zum Absolvieren des Semesters

Legfeljebb 3 foglalkozásról történő hiányzás megengedett.

Semesteranforderungen

Projekt munka: egy klónozási folyamat megtervezése

Möglichkeiten zur Nachholung der Fehlzeiten

Nincs.

Prüfungsfragen

http://biofizika.aok.pte.hu

Prüfer

Praktika, Seminarleiter/innen

• Grama László
• Kengyel András Miklós
• Talián Csaba Gábor