Microscopy and Image Analysis

Adatok

A Tantárgybejelentőben megadott hivatalos adatok az alábbi tanévre: 2024-2025

Tantárgyfelelős

  • Bugyi Beáta

    associate professor,
    Department of Medical Biology and Central Electron Microscope Laboratory

Óraszámok/félév

előadás: 12 óra

gyakorlat: 0 óra

szeminárium: 0 óra

összesen: 12 óra

Tárgyadatok

  • Kód: OSE-MKA-T
  • 1 kredit
  • Dentistry
  • Elective modul
  • spring
Előfeltétel:

Nincs

Vizsgakurzus:

Kurzus létszámkorlát

min. 5 fő – max. 15 fő

Campus kurzusként elérhető . Campus-karok: GYTK TTK

Tematika

Modern microscopic methods used in biomedical research, as well as the principles and practice of related digital image processing and analysis, are presented. Students can acquire knowledge related to microscopic imaging methods and image analysis by solving practical problems, analyzing case studies, and doing independent computer work (image analysis software, e.g. ImageJ, Fiji, Imaris, etc.). Strong emphasis is laid on hands-on skills. The course supports practical skills that help research or Students’ research (TDK) work and can contribute to a better understanding of the corresponding topics of compulsory subjects (e.g. molecular cell biology, cell biology, histology, anatomy).

Module 1 - introduction: Basic principles of microscopic imaging methods.

Module 2 - interactive sessions: Practical aspects of microscopic imaging methods.

Module 3 - interactive sessions: Basics of digital image processing and analysis.

Előadások

  • 1.

    Basic principles of microscopic imaging methods used in biomedical research.

    - Bugyi Beáta
  • 2.

    Basic principles of microscopic imaging methods used in biomedical research.

    - Leipoldné Vig Andrea Teréz
  • 3.

    Light microscopy. Fluorescence microscopy. How to build a light microscope.

    - Bugyi Beáta
  • 4.

    Light microscopy. Fluorescence microscopy. How to build a light microscope.

    - Bugyi Beáta
  • 5.

    Electron microscopy.

    - Bugyi Beáta
  • 6.

    Cryo-electron microscopy.

    - Bugyi Beáta
  • 7.

    Image analysis 1.

    - Bugyi Beáta
  • 8.

    Image analysis 2.

    - Bugyi Beáta
  • 9.

    Image analysis 3.

    - Gaszler Péter
  • 10.

    Image analysis 4.

    - Gaszler Péter
  • 11.

    Workshop. Students' projects and presentations.

    - Bugyi Beáta, Szütsné Tóth Mónika Ágnes
  • 12.

    Workshop. Students' projects and presentations.

    - Bugyi Beáta, Szütsné Tóth Mónika Ágnes

Gyakorlatok

Szemináriumok

A tananyag elsajátításához szükséges segédanyagok

Kötelező irodalom

Saját oktatási anyag

Can be found on MS Teams group of the course.

Jegyzet

Ajánlott irodalom

John C. Russ Introduction to Image Processing and Analysis ISBN-13: 978-0849370731

Toennies, Klaus D. Guide to Medical Image Analysis ISBN: 978-1-4471-7320-5

Chris Solomon & Toby Breckon Fundamentals of Digital Image Processing ISBN-13: 978-0470844731

A félév elfogadásának feltételei

A maximum of 25% absence is allowed.

Félévközi ellenőrzések

Grading policy

The grade is based on the result of

a written test,

or short (5-10 minutes) presentations of Students’ projects.

Távolmaradás pótlásának lehetőségei

The opportunity to make up for absence can be discussed with the course leader.

Vizsgakérdések

No exam is scheduled in the exam period.

Vizsgáztatók

Gyakorlatok, szemináriumok oktatói