Kutatás

Farmakoinformatikai Kutatócsoport

A Farmakoinformatikai Kutatócsoport 2016-ban kezdte meg működését Intézetünkben, Hetényi Csaba egyetemi docens vezetésével. A kutatócsoport fő profilja a gyógyszertervezéshez használható kémiai informatikai és szerkezeti bioinformatikai módszerek fejlesztése és alkalmazása. E módszereket ma már minden jelentős gyógyszeripari vállalat kiterjedten felhasználja a gyógyszerkutatás korai fázisában. Jelenlegi munkánk előterében a gyógyszer-célpont kölcsönhatások szerkezetének és termodinamikájának számítása áll. Eszköztárunkba több nyílt forráskódú (ingyenes) szoftver tartozik, mint például molekuláris dinamikai (Gromacs) vagy dokkoló (AutoDock) eljárások. Alkalomszerűen használunk kvantumkémiai programokat is. A csoportunk által fejlesztett programok szintén nyílt forráskódúak. A MobyWat nevű program (www.mobywat.com) a célpont fehérjék és a gyógyszer-célpont interfészek hidrát-szerkezetének számítására alkalmas. A Wrap ‘n’ Shake nevű módszerünk (www.wnsdock.xyz) pedig a gyógyszerek kötőhelyének szisztematikus feltérképezését végzi el, ami a gyógyszerek hatástanának kulcskérdése. Számos kutatócsoporttal működünk együtt szerkezeti biokémiai kérdéseik megválaszolását segítve. Intézetünkön belül az SST4 ás TRPA1 célfehérjék gyógyszertanának felderítésében veszünk részt. Ezen túlmenően az Alzheimer-kór amiloid peptidjétől a motorfehérjéken, a szérum albuminon, az epigenetikában fontos hisztonokon át a jelátviteli útvonalakban szereplő kinázokig bezárólag a legkülönfélébb fehérjékkel kapcsolatban értünk és érünk el eredményeket. A kutatott rendszerek e széles spektruma is illusztrálja farmakoinformatikai módszereink változatos alkalmazási lehetőségeit.

Kapcsolattartó: Dr. Hetényi Csabahetenyi.csaba@pte.hu