Főoldal
Oktatás

Introduction to Bioinformatics - Practice

Adatok

A Tantárgybejelentőben megadott hivatalos adatok az alábbi tanévre: 2026-2027

Tantárgyfelelős

  • Hetényi Csaba

    associate professor,
    Department of Pharmacology and Pharmacotherapy

Óraszámok/félév

előadás: 0 óra

gyakorlat: 28 óra

szeminárium: 0 óra

összesen: 28 óra

Tárgyadatok

  • Kód: OBA-136_25-G
  • 2 kredit
  • Biotechnology MSc
  • Basic modul
  • spring semester
Előfeltétel:

Nincs

Kurzus létszámkorlát

min. 1 fő – max. 999 fő

Campus kurzusként elérhető . Campus-karok: ÁOK GYTK TTK

Tematika

The course provides a general introduction to Bioinformatics. A survey of practical applications follows a brief theoretical overview for each sub-topic. The handling of omics and structural data, along with the corresponding file types, is introduced. A special emphasis is placed on structure-based drug design methodologies. Basic skills are practiced in the computer lab for each topic. The course is mostly based on open-source or free software, and students are encouraged to further improve their computer skills through homework on their personal computers.

Előadások

Gyakorlatok

  • 1. The bioinformatics toolkit 1 - Hetényi Csaba
  • 2. The bioinformatics toolkit 1 - Hetényi Csaba
  • 3. The bioinformatics toolkit 2 - Hetényi Csaba
  • 4. The bioinformatics toolkit 2 - Hetényi Csaba
  • 5. Databases - Börzsei Rita Judit
  • 6. Databases - Börzsei Rita Judit
  • 7. Sequence alignments and comparisons - Börzsei Rita Judit
  • 8. Sequence alignments and comparisons - Börzsei Rita Judit
  • 9. Molecular representations - Börzsei Rita Judit
  • 10. Molecular representations - Börzsei Rita Judit
  • 11. Structural measurements and manipulations - Börzsei Rita Judit
  • 12. Structural measurements and manipulations - Börzsei Rita Judit
  • 13. Test 1 - Börzsei Rita Judit, Hetényi Csaba
  • 14. Test 1 - Börzsei Rita Judit, Hetényi Csaba
  • 15. Building of biomolecular targets - Börzsei Rita Judit
  • 16. Building of biomolecular targets - Börzsei Rita Judit
  • 17. Building of ligands - Börzsei Rita Judit
  • 18. Building of ligands - Börzsei Rita Judit
  • 19. Rational drug design - Börzsei Rita Judit
  • 20. Rational drug design - Börzsei Rita Judit
  • 21. Omics analyses - Hetényi Csaba
  • 22. Omics analyses - Hetényi Csaba
  • 23. The bioinformatics toolkit 3 - Hetényi Csaba
  • 24. The bioinformatics toolkit 3 - Hetényi Csaba
  • 25. Pharmacoinformatics - Zsidó Balázs Zoltán
  • 26. Pharmacoinformatics - Zsidó Balázs Zoltán
  • 27. Test 2 - Hetényi Csaba, Börzsei Rita Judit
  • 28. Test 2 - Hetényi Csaba, Börzsei Rita Judit

Szemináriumok

A tananyag elsajátításához szükséges segédanyagok

Kötelező irodalom

Saját oktatási anyag

The material of the course including PDFs of practice handouts will be made downloadable from the website of the Department of Pharmacology and Pharmacotherapy or from TEAMS or a link will be provided during the lectures / in an e-mail.

Jegyzet

Ajánlott irodalom

Paul M. Selzer, Richard J. Marhöfer, Oliver Koch
Applied Bioinformatics

A félév elfogadásának feltételei

- Homework accomplished
- Test writing OR test work accomplished

Félévközi ellenőrzések

- Homework
- Test writing OR test work

Távolmaradás pótlásának lehetőségei

Replacement is not possible.

Vizsgakérdések

Not applicable.

Vizsgáztatók

  • Börzsei Rita Judit
  • Hetényi Csaba
  • Zsidó Balázs Zoltán

Gyakorlatok, szemináriumok oktatói

  • Börzsei Rita Judit
  • Hetényi Csaba
  • Zsidó Balázs Zoltán
Rólunk