Az Intézetben 2001 óta folynak az Országos Egészségbiztosítási Pénztár által finanszírozott klinikai labordiagnosztikai vizsgálatok. Autoantitest diagnosztika immunszerológiai módszerekkel, illetve sejtfelszíni és intracelluláris molekulák kimutatása áramlási citometriával a két fő klinikai diagnosztikai tevékenységi profil. A vizsgálatok spektruma és száma folyamatosan bővül, elsősorban a régióban dolgozó klinikai orvosok igényeinek figyelembevételével.
2008. március óta az immunológiai diagnosztikai laboratórium NAT által akkreditál vizsgáló laboartóriumként működik. A diagnosztikai laboratórium az MSZ EN ISO 15189:2023 minőségbiztosítási rendszerben a NAH -9-0007/2021 számon akkreditált vizsgáló laboratórium.
A vizsgálatokkal kapcsolatos dokumentumok az Immunológiai és Biotechnológiai Intézet honlapján (http://www.immbio.hu) Diagnosztika menüpontjában találhatók.