- Aneszteziológiai és Intenzív Terápiás Intézet
- Bőr-, Nemikórtani és Onkodermatológiai Klinika
- Érsebészeti Klinika
- Fogászati és Szájsebészeti Klinika
- Fül-Orr-Gégészeti és Fej-Nyaksebészeti Klinika
- Gyermekgyógyászati Klinika
- I. sz. Belgyógyászati Klinika
- Idegsebészeti Klinika
- II.sz. Belgyógyászati Klinika és Nephrológiai, Diabetológiai Centrum
- Immunológiai és Biotechnológiai Intézet
- Klinikai Gyógyszerészeti Intézet
- Laboratóriumi Medicina Intézet
- Neurológiai Klinika
- Onkoterápiás Intézet
- Ortopédiai Klinika
- Orvosi Genetikai Intézet
- Orvosi Képalkotó Klinika
- Orvosi Mikrobiológiai és Immunitástani Intézet
- Orvosi Rehabilitáció és Fizikális Medicina önálló Tanszék
- Pathológiai Intézet
- Pszichiátriai és Pszichoterápiás Klinika
- Reumatológiai és Immunológiai Klinika
- Sebészeti Klinika
- Sürgősségi Orvostani Tanszék
- Szemészeti Klinika
- Szívgyógyászati Klinika
- Szülészeti és Nőgyógyászati Klinika
- Traumatológiai és Kézsebészeti Klinika
- Urológiai Klinika