- Ápolásszakmai Igazgatóság
- Egészségügyi Beszerzési Igazgatóság
- Egészségügyi Gazdálkodási Igazgatóság
- Egészségügyi Humánpolitikai Igazgatóság
- Egészségügyi Szolgáltatási Főosztály
- Foglalkozás-egészségügyi és Munkahigiénés Központ
- Kórházhigiénés Szolgálat
- Minőségirányítási Osztály
- Orvosszakmai Igazgatóság
- Stratégiai Igazgatóság
- Elnöki Hivatal
- Adatvédelmi és Betegjogi Osztály
- Klinikai Vizsgálatok Koordinációs Központja
- Egészségügyi Gazdálkodási Főigazgatóság
- HR